Mission : Equipe Osiris, Développement et support informatique d’un outil d’étude et de supervision de compteurs 2G/3G – Développements, Administration système, Gestion de bases de données.
Activités :
- Développement de l’application Osiris.
- Installation/Support de l’application
- Audit, définition des besoins utilisateur, étude de faisabilité.
- Administration (Linux, Unix) et de serveurs (MySQL, Apache, Ftp)
Définition du projet :
- Le projet Osiris et un projet de supervision de données 2G/3G sur le réseau national et international.
- Développement d’une couche de récupération de compteurs, d’agrégation et de calculs d’indicateurs (Awk, PHP, Shell Unix, SSH, FTP, MySQL, Java).
- Développement d’une application Web de présentation des résultats (PHP, HTML, JavaScript, CSS, Flash, MySQL).
- Support aux utilisateurs, administration des différents serveurs (MySQL, Apache), administration système (Linux, Ubuntu).
Mission : Equipe SCDM, Support informatique aux équipes de recherche (biologie/chimie) – Développement, Administration système, Gestion de bases de données.
Activités :
- Audit, définition des besoins utilisateurs, étude de faisabilité.
- Développement d’applications Web ou tierces.
- Installation/Support de logiciels métiers privés ou Open Source.
- Administration de machines (Linux, Unix) et de serveurs (Apache, Ftp).
Exemples de projets :
- Développement d’une base de données de composés chimiques avec interrogation, visualisation 3D, et mise à jour via portail Web (Perl, CGI, Html, Oracle, Shell Unix, Serveur Ftp, Serveur Apache).
- Développement d’un outil de synchronisation de bases de données via ftp en temps réel (Perl, CSH, LFTP, PostgreSQL).
- Installation et administration de serveurs d’analyses pour chimistes/biologistes : Accelrys Wisconsin Package (Unix), Accelrys Medchem Explorer (Window), Emboss (Open Source).
- Installation et administration d’environnements d’analyses pour biologistes : outils et bases de données spécifiques, gestions de serveurs Web et ftp (Unix).
Mission : Equipe SCDM, Développement, Administration système, gestion de bases de données et support d’une plateforme d’analyse biologique.
Activités :
- Définition des besoins utilisateurs, rédaction de documentation administrateur et utilisateur.
- Développement d’applications Web ou tierces.
- Installation/Support de logiciels métiers privés ou Open Source.
- Installation/Support de bases de données.
- Administration de serveurs (Apache, Ftp).
Projets :
- Développement et Installation de logiciels d’analyse (Web et StandAlone).
- Installation et administration d’un serveur d’analyse pour les chercheurs (Accelrys Wisconsin Package - Unix) ainsi que de divers outils Open Source.
- Installation de bases de données biologiques (MySQL et Flat Files), ainsi que d’un outil de mise à jour semi-automatique.
Nom du responsable : Moez Majed, Directeur.
Mission : Développement de solutions propres à la société, ainsi que de solutions au besoin.
Activités :
- Définition des besoins utilisateurs, étude de faisabilité.
- Développement d’applications Web : Perl CGI, Html, PostgreSQL/Mysql/Oracle.
- Développement d’applications StandAlone : Perl, Shell Unix.
- Installation/Support de logiciels privés ou Open Source chez le client.
- Administration de machines (Linux) et de serveurs (Apache, Ftp).
Exemples de projets :
- Développement d’une solution d’analyse sécurisée Web/CGI couplée à une base de données pour les laboratoires de recherche (Perl/CGI, MySQL, Shell Unix, Ftp, HTML, PHP).
- Installation et configuration de plateformes d’analyse au besoin (Logiciels Open Source, Administration Linux, Apache) pour divers clients.
- Installation et administration de serveurs d’analyses pour chimistes/biologistes : Accelrys Wisconsin Package (Unix).
- Elaboration, design, installation du site Web de la société (PHP, HTML, CSS, Javascript, Photoshop).
Nom du responsable : Catherine Belleannée (Maître de Conférence).
Mission :
Stage effectué au sein de l’Equipe Irisa, dans le cadre du DEA génomique et Informatique en collaboration avec l’UPRES-A 6026 du CNRS.
Activités :
Conception d’un analyseur syntaxique de séquences protéiques réalisée en JAVA pour l’interface graphique, avec un moteur d’analyse réalisée en Prolog.
Projets :
- Développement d’une interface utilisateur en Java.
- Développement d’un moteur d’expression régulière en Prolog.
- Développement du moteur de calcul multiprocesseur en Perl.
Entreprise : Irisa (Institut de Recherche en Informatique et Système).
Fonction : Stagiaire
Domaine : Bioinformatique
Ville : Rennes (35)
Durée : 4 mois.
Nom du responsable : Jacques Nicolas (Responsable projet Symbiose).
Mission :
Stage effectué au sein de l’Equipe Irisa, dans le cadre du DUT Informatique en collaboration avec l’UPRES-A 6026 du CNRS.
Activités :
Intégration de données biologiques dans une base de données relationnelles, avec réalisation d’un outil Web d’interrogation et d’analyse.
Projets :
- Analyse de l’existant.
- Design et implémentation de la base de données (MySQL).
- Analyse et installation des outils d’analyse (Blast).
- Implémentation de l’interface utilisateur (Web/CGI, Perl, PHP).